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Aplicación de la técnica de High Resolution Melting para la identificación de bacterias degradadoras de hidrocarburos

Trabajo presentado en el XLIV Congreso Argentino de Genética llevado a cabo en la ciudad de Mar del Plata del 13 al 16 de Septiembre de 2015.

Autores:

Izzo SA (1), S Quintana (2), M Costagliola (1), S Peressutti (1).

(1) Gabinete de Biología Molecular y Microbiología del Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero (INIDEP).

(2) Área Biología Molecular de Fares Taie Instituto de Análisis.

Resumen

Los hidrocarburos poliaromáticos (HPAs) representan un peligroso agente contaminante de ambientes acuáticos debido a sus propiedades tóxicas, mutagénicas y carcinogénicas, y a su capacidad de bioacumularse.

El Río de la Plata es un ambiente muy productivo desde el punto de vista ecológico y pesquero. Sin embargo, el mismo se ve afectado por la presencia de diversos hidrocarburos, como HPAs, originados a partir de la actividad portuaria e industrial.

La degradación de hidrocarburos a cargo de bacterias autóctonas de un ambiente contaminado es una opción atractiva para eliminar estos compuestos de manera natural. La detección de bacterias degradadoras a través de un método de diagnóstico rápido y eficiente, constituye una manera importante de promover la implementación de técnicas de biorremediación.

El objetivo de este trabajo fue evaluar el uso de la técnica de High Resolution Melting (HRM) como método rápido de identificación de bacterias degradadoras de HPAs, aisladas de la desembocadura del Río de la Plata. Se realizó la amplificación por PCR en tiempo real de una región del gen ARNr 16S a partir de ADN de 29 cepas, previamente identificadas por secuenciación del ARNr 16S y evaluadas según su capacidad de degradación por HPLC.

Mediante el análisis de HRM  se lograron identificar 10 géneros distintos y dentro del género Pseudomonas se detectaron 3 patrones de HRM que logran diferenciarlas a nivel de especie. En este trabajo se logró implementar un método rápido y eficiente de HRM para la detección y diferenciación de bacterias degradadoras de hidrocarburos en el ambiente.

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